La Estación Biológica Manu (Ex Villa Carmen) es nuestra estación en el piedemonte de los Andes y el inicio de la llanura Amazónica. Se encuentra en Pilcopata, Valle de Kosñipata, Cusco, a 550 m de elevación en el valle bajo del Río Piñipiñi, el cual drena los contrafuertes Andinos del Parque Nacional del Manu. Ubicada en la confluencia del Río Piñipiñi con el Rio Pilcopata en la reserva de la Biosfera del Manu, nuestra estación está rodeada por una reserva de 3,066 ha. El área donde está enclavada la reserva constituye una encrucijada natural y cultural excepcional. Al pie de la cordillera de Los Andes, en los alrededores de Manu, se encuentran el bosque nublado Andino y la selva baja amazónica, asi como culturas indigenas amazónicas y andinas.

Establecida en 2010, Manu cuenta con un gradiente de 650 m de elevación, desde los 550 m en la parte más baja, hasta los 1200 m en la cresta del cerro Teparo Punta. Este gradiente permite el acceso a varios hábitats terrestres incluyendo el bosque premontano, el bosque montano bajo, el bosque enano musgoso, bosques de bambu (pacales), y vegetación en sucesión primaria y secundaria a las orillas de los ríos, en zonas de derrumbes y en antiguas áreas agropecuarias. Así mismo, existen una gran cantidad de cuerpos de agua en la reserva, incluyendo quebradas dentro del bosque, ríos de agua blanca y de agua clara, y pequeñas lagunas y humedales.

Con una capacidad para 50 visitantes, las instalaciones incluyen un salón multipropósito que sirve de area de alimentación, 200 m2 de laboratorio, así como salas de conferencia y talleres. La reserva cuenta con 50 km de trochas, y una oroya para cruzar el rio Piñipiñi. Desde 2012, nuestro programa de becas ha traído a más de 10 investigadores a la estación. Manu también ofrece varios cursos de campo cada año, los cuales son administrados por universidades y programas académicos aliados.
Las oportunidades en Manu para los investigadores en ecología aplicada y desarrollo sostenible incluyen áreas agropecuarias en uso continuo. El pueblo grande más cercano es Pillcopata que se encuentra a 1.5 km por carretera.

El clima de Manu es cálido y lluvioso con una temperatura promedio anual de 23 grados y una precipitación promedio anual es de 5300 mm. Durante el invierno (mayo-setiembre) la región es afectada por frentes fríos que traen tiempo seco y mínimas extremas que pueden aproximarse a los 10°C.